Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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