Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
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