Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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