Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms