Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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SGCGQ13326 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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SGCGQ13326 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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SGCGQ13326 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SGCGQ13326 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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SGCGQ13326 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SGCGQ13326 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SGCGQ13326 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SGCGQ13326 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SGCGQ13326 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SGCGQ13326 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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SGCGQ13326 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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SGCGQ13326 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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SGCGQ13326 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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SGCGQ13326 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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