Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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