Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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TRAF2Q12933 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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TRAF2Q12933 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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TRAF2Q12933 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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