Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms