Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms