Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms