Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms