Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms