Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms