Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms