Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms