Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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