Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEMP55040 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEMP55040 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms