Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB4P54760 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB4P54760 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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