Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HK3P52790 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HK3P52790 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms