Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms