Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms