Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms