Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCAMP43121 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCAMP43121 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCAMP43121 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCAMP43121 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCAMP43121 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCAMP43121 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCAMP43121 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCAMP43121 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCAMP43121 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCAMP43121 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCAMP43121 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCAMP43121 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms