Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF9P41273 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms