Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.8 ms