Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms