Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms