Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR3P22607 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms