Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL2P13500 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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