Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CETPP11597 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CETPP11597 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms