Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms