Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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