Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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