Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms