Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms