Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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SH3BP1Q9Y3L3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SH3BP1Q9Y3L3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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