Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms