Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms