Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms