Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SIGMAR1Q99720 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SIGMAR1Q99720 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SIGMAR1Q99720 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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SIGMAR1Q99720 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SIGMAR1Q99720 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SIGMAR1Q99720 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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SIGMAR1Q99720 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SIGMAR1Q99720 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SIGMAR1Q99720 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SIGMAR1Q99720 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SIGMAR1Q99720 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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