Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms