Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms