Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms