Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms