Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms