Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC186Q7Z3E2 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC186Q7Z3E2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms