Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms