Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms