Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms