Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms